Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms