Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms