Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms