Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBDC1Q9BVG4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms