Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MCMBPQ9BTE3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms