Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TIMM29Q9BSF4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms