Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGIP1Q9BQI5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGIP1Q9BQI5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms