Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX2Q9BQ50 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TREX2Q9BQ50 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms