Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms