Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5SQ99766 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms