Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms