Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC9Q96Q05 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms