Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NSMCE2Q96MF7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms