Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms