Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms