Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG1Q96JA1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms