Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX11Q96FC9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms