Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDC3Q96F86 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms