Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms