Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA10Q969M2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms