Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFKQ969G6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms