Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD50Q92878 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms