Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4DQ92854 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4DQ92854 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms