Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDB2Q92466 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms