Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTTNBP2Q8WZ74 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTTNBP2Q8WZ74 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms