Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D1Q8WV19 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms