Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms