Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A3Q8NEV1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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