Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC112Q8NEF3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC112Q8NEF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms