Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf106Q8NAJ2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf106Q8NAJ2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms