Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00612Q8N6U2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms