Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TMCO5AQ8N6Q1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMCO5AQ8N6Q1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMCO5AQ8N6Q1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TMCO5AQ8N6Q1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TMCO5AQ8N6Q1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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TMCO5AQ8N6Q1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TMCO5AQ8N6Q1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMCO5AQ8N6Q1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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TMCO5AQ8N6Q1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMCO5AQ8N6Q1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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