Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VWDEQ8N2E2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWDEQ8N2E2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms