Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms