Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC83Q8IWF9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms