Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP13Q86W25 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP13Q86W25 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms