Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H3

CATIP, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATIPQ7Z7H3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATIPQ7Z7H3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATIPQ7Z7H3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms