Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF550Q7Z398 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms