Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRCQ7RTU9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms