Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms