Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP50Q70EL3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms