Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00299Q6ZSB3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms