Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms