Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UQCC3Q6UW78 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UQCC3Q6UW78 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms