Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms