Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC1Q6TDU7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms