Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL35Q6PF15 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms