Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD2Q6P5Q4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms