Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPP4R4Q6NUP7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms