Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD2Q6NTF9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHBDD2Q6NTF9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms